近年来，微山县畜牧业生产立足湖区资源优势，科学调整畜禽养殖结构，大力发展优质、高效、生态、安全的畜牧业，形成了以生态肉鸭养殖加工产业化，生猪、禽蛋规模养殖及食草畜禽、特种动物养殖为主线的具有鲜明特色的畜禽养殖格局，畜牧业产值占到了全县农业总产值的三分之一以上。

　　 生态肉鸭养殖加工实现产业化。大力实施了以生态肉鸭养殖宰杀为主线的农业产业化建设，大力发展生态养殖和品牌建设。目前，全县肉鸭养殖量已达到3500万只，日宰杀能力达到10万只。生态肉鸭宰杀企业由原来的1家发展到5家，全县生态肉鸭养殖大棚1560座，鸭产品加工企业231家。其中鸿运食品有限公司、宏信食品有限公司、县食品公司、振宇食品公司等龙头企业逐步发展壮大，并通过“企业+基地+农户”的现代养殖业发展模式，以点带面，辐射带动了全县肉鸭养殖加工产业，拉长壮大了产业链条。今年4月份，雨润集团畜禽屠宰加工项目正式落户微山，这一项目的实施将有力地促进全县畜禽产业的大发展，示范带动养殖基地（小区）建设，推动全县畜禽产业再上一个新台阶。

　　 突出抓好地方水禽良种微山麻鸭品种资源保护与开发工作。微山麻鸭是微山县独有的地方水禽良种，具有行动敏捷、善潜水、觅食力强的生物特性，及肉质细嫩、蛋大质优的经济特性，被省政府列入《山东省畜禽遗传资源保护名录》。为做好微山麻鸭这一地方优良水禽品种资源的保护、利用与开发，2006年微山县开展了微山麻鸭品种资源调查工作，掌握了微山麻鸭养殖数量、区域分布、品种特性等。2009年根据微山麻鸭品种资源调查数据材料，完成了《微山麻鸭》山东省地方标准修订工作，制定了微山麻鸭品种资源保护与开发利用规划，对微山麻鸭原种场进行了标准化改扩建。同时，积极申报微山麻鸭地理标志商标注册，投资2万余元进行了商标设计工作，对微山麻鸭活体、微山麻鸭产品、微山麻鸭蛋3个品种进行了商标注册，省畜牧兽医局、省家禽研究所出具了微山麻鸭产地证明及品质证明，今年9月份，国家工商总局对微山麻鸭产品商标进行了公示。2011年微山麻鸭被农业部列入国家级种质资源保护项目，为今后开发利用微山麻鸭品种资源打下了坚实基础。

　　 积极推进规模养殖场标准化建设。充分利用国家扶持政策，推进养殖场标准化建设。自2007年以来，该县实施了15处标准化生猪养殖场建设项目，项目总投资1246.32万元，其中中央配套资金445万元，极大地推动了生猪标准化养殖进程。实施以奖代补推进3处蛋鸡规模养殖场进行标准化改造，项目完成投资38.16万元，中央财政一次性奖励24万元。2010年创建了国家级、省级畜禽养殖示范场各1家，韩庄正为养殖有限公司、金鸡养殖有限公司分别通过了国家级、省级畜禽养殖示范场建设项目验收，取得了无公害畜产品认证。全县有2家企业取得绿色食品认证，5家养殖加工企业被认定为省级龙头企业，12家养殖加工企业被认定为市级龙头企业。2011年申报省政府扶持“菜篮子”产品畜牧业生产项目1项，申报标准化猪场改造5项，市级标准化畜禽养殖基地建设项目6项。

　　 大力发展食草畜禽及特色养殖。微山的特种畜禽品种类主要是水貂、狐狸、貂、野猪，肉鸽、鹌鹑、山鸡等也有少量养殖。目前该县特种动物饲养量达50万只，其中出栏千头的饲养大户近100户。主要分布于两城、西平、付村等乡镇，数量最多、规模最大的貂狐貉养殖主要是两城镇。为促进发展，两城镇还成立了特种动物养殖协会，协会在引进良种、技术推广、提供信息、联系销售、防病治病等方面为会员提供优质服务。近年来，该县已引进芬兰狐、美国黑貂等优良品种对本地种群实施杂交改良，提高了种群质量。野猪产业有了较快发展，形成了规模化生态野猪繁育基地一处，该基地逐步形成特种野猪良种繁育、商品猪育成、屠宰加工、连锁销售为一体的规模化产业化养殖模式，年可出栏商品野猪5500头。肉牛等食草畜禽养殖稳步发展，突出抓好了肉牛养殖场标准化建设项目，提高养殖标准，促进特色养殖产业发展。