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1、潜伏期
该阶段是动物机体和病原微生物或致病因素之间的一种损伤与抗损伤的过程。从临床上讲，此时鸡群没有明显的临床症状，如果机体抵抗力占上风，鸡群会耐过或向健康的方向发展。反之，疾病会向更深入的阶段发展，进入疾病的前驱期。
建议潜伏期的管理重点是减少各种应激的发生，对非健康鸡群免疫时要慎重。
2、前驱期
集群开始出现以精神、采食和生产性能等为主的临床变化，有经验的或细心的养殖户能察觉到鸡群的异常。与其他疾病不同的是，肉鸡感冒在此阶段传播速度快，呼吸道症状可在两天内波及全群，随之采食量严重下降。剖检可看到气管严重出血，如红布条状。
建议及时给药，以抗病毒、消炎为主。（此时建议用瘟疫康散拌料+栓塞咳喘散拌料）如果不能准确用药控制，往往加剧疾病的发展速度和严重程度。
3、明显期
我们将这一阶段称作疾病高峰期。也是临床表现最严重的时期。表现鸡只精神极度沉郁，呼吸困难，张口喘息，怪叫等症状，死亡率不断增加。剖检可见气囊炎、肺坏死、甚至支气管栓塞，个别出现肾衰竭、出血等。
建议此阶段的管理以保温为主。在投喂药物的同时应改善舍内环境，否则，投服任何药物无效。（此刻建议用药为新感康饮水治疗+清肺利肝口服液饮水治疗+气囊净饮水治疗）药物的选择以对症治疗和抗继发感染为主。
4、转归期
对于该病而言，动物体的抵抗力得到改进和增强，但极易继发细菌性疾病，尤其是大肠杆菌病。（需要大肠杆菌的药）
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