双黄连对多种病原菌有抑制作用，对革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌如链球菌、肺炎双球菌、金色葡球菌、副伤寒杆菌、大肠杆菌、 绿脓杆菌、痢疾杆菌、志贺氏痢疾杆菌、变形杆菌、小肠结肠炎耶氏菌等均有不同程度的抑制作用。双黄连具有明显抗流感病毒、 呼吸道合胞病毒、腺病毒Ⅲ、单纯胞疹病毒Ⅰ及Ⅱ型、柯萨奇病毒B，A、新型肠道病毒71型的作用。对脊髓灰质炎病毒Ⅲ型、埃克病毒6型、麻疹病毒、水泡性口炎病毒有一定的抑制作用，并能显著抑制肺炎、心肌炎、胰腺炎的发生，疗效与清开灵相似。还具有清肺热、解肌表之热，而金银花配合连翘能辛凉透邪以清热，同时具有抗炎症效果。其不仅仅是单一的抑制和杀灭外来的病原微生物，同时还有增强宿主免疫力的作用。
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